DNAウイルスは
RNAウイルスと異なり、ゲノムの構造に多様性がない。ほとんどが二本鎖DNAウイルスであり、そうでないウイルスは一本鎖-鎖DNAウイルスの
パルボウイルス科と不完全二本鎖DNAウイルスの
ヘパドナウイルス科のみである。DNAの構造はほとんどが環状であり、線状DNAを有するのは
パポバウイルス科のみである。なお、一本鎖DNAウイルスゲノムはそのままでは増殖できないため、宿主細胞のDNAポリメラーゼを使い二本鎖の状態を経て増殖する。また、ペパドナウイルスは非常に特異的な増殖様式を取る。部分的に一本鎖があるこのウイルスは宿主細胞内で完全な二本鎖DNAウイルスとなり、mRNAを合成する。そしてDNAの合成はそのmRNAを
逆転写することで合成される。