建仁3年(
1203年)、頼家が病床に伏し、8月に危篤状態に陥った。
鎌倉幕府北条氏編纂書である『
吾妻鏡』によると、8月27日に
北条時政は一幡と頼家の弟・
実朝に頼家遺領分与を決定し、関東28ヶ国地頭職と日本国総守護職を一幡に、関西38ヶ国地頭職を実朝に相続する事になった。これに不満を持った能員は、頼家に実朝擁立を計る時政の謀反を訴え、頼家は時政追討を能員に命じる。しかし、この密議を障子の影で立ち聞きしていた政子が時政に告げ、先手を打った時政は
大江広元の支持を取り付けると、9月2日、仏事の相談があるとして能員を時政の自宅である名越邸に呼び出す。密議が漏れている事を知らない能員は、さかんに引き止めて武装するように訴える一族に「武装したりすればかえってあやしまれる」と振り切り、平服のまま時政の屋敷に向かう。門を通って屋敷に入ったところを、武装して待ちかまえていた
天野遠景、
仁田忠常ら時政の手勢に両腕を取り押さえられ、引き倒されたところを刺し殺された。