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伴性遺伝(はんせいいでん、ばんせいいでん)とは、性染色体に依存する遺伝である。この現象は、X染色体・Y染色体・Z染色体・W染色体に遺伝子座をもつ遺伝子に支配される。基本的には雌雄で性染色体の数が異なるために生じる現象である。伴性遺伝の中で、特に片側の性のみに遺伝する場合、例えばY染色体・W染色体特有の遺伝子による遺伝などを、特に限性遺伝と呼ぶ。

例えばヒトではY染色体上に男性を決定づけるSRYという遺伝子があるため、この染色体をもつ個体は男になる。他には、色覚異常の劣性変異はX染色体上にあるため、X染色体を一つしか持たない男性は、二つもつ女性に比べて色覚異常の率がはるかに高い。また血友病も伴性遺伝の例である。

遺伝学によって明らかとなった伴性遺伝の最初の例は、ショウジョウバエにおける白眼変異の交配である(図)。これは染色体説を支持する最初の結果でもあった。

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